洁净室在运行中所消耗的能量主要来源以下几个部分：
1、  新风热、湿处理所消耗的能量
根据国家规范的规定，由于卫生要求，洁净室内工作人员所需新风量，维持室内正压所需的新风量，系统的排风量，系统及洁净室的漏风量。这些新风量之和，对于10万洁净室则大于等于30%，1万级洁净室不低于20%，1000级洁净室则不低于10%，水平单向流洁净室为不低于4%，垂直单向流洁净室内不低于2%，相当于洁净室约5~10次换气，为同样一般空调面积送风量的1~1.5倍。
2、  由系统中风机的温升所消耗的能量。
由于净化空调系统中送（回）风量都比较大，在运行中风机所消耗的电能将会有一部分变为输送空气的动能，而另一部分则转换为热能而散发于空气中。
3、  由于洁净室的送风量比一般空调系统要大得多，所使用的风机风量大，而且为克服系统的空气阻力风机的压头要多出500~700Pa，约占一般系统的压头一半左右。因此洁净室运行的动力负荷要比一般空调的动力负荷大3-30倍。
4、  由于工艺设备运转所消耗的能量。
鉴于以上情况，洁净室中净化空调系统在运行中的节能问题，可以从以下几个方面来解决。
1、  减少系统的送风量
2、  改变洁净室要求的温、湿度基数
3、  减少排风量
4、  适当降低洁净室内的静压值
5、  采用低阻力空气过滤器
6、  非工作时间采用值班风机运行，关闭系统中的送、回风机
7、  在设置循环风机的净化空调系统中的节能
8、  尽量减少由于风机、电动机的温升而消耗处理空气的能量
9、  减少净化空调系统和空调器的漏风量